鄭芝龍不是沒有動過向福建官府尋求招安的念頭，事實上他從整合十八芝的時候就已經有這方面的考慮，畢竟當海盜就算當得再怎麼風光，就算已經成為了遠東地區勢力最大的海盜頭子，也終究無法進入到主流社會，更談不上光宗耀祖，終究還是要想辦法洗白上岸的。＋◆，鄭芝龍所策劃的路線就是依靠武力控制福建海域，脅迫官府拿出優厚條件來招安自己，而且這個路子在頭幾年的時候實施得還算順利，熊文燦的確也找人來向他試探過招安的可能性。
但前幾年還有這種意向的對手在最近兩年卻已經改變了態度，隻字不再提起招安之事。鄭芝龍找過不少中間人去打聽口風，據說這種態度轉變有大部分原因都是許心素從中作梗造成的。當然了，這也很好理解，畢竟鄭芝龍手裡的海上武裝比福建水師還強大，招安之後誰聽誰的還真是不好說，加之許心素跟鄭芝龍的私人恩怨幾乎不可能完全化解，他要保住自己在明軍中的地位，自然不願意憑空冒出一個強有力的競爭對手來。
若是許心素像他的前任俞諮皋那樣屢戰屢敗，說不定福建巡撫熊文燦早就已經下招安文書了，但偏偏最近這幾年許心素戰績彪炳，逐步收回了福建沿海那些曾經被十八芝佔領的失地，而十八芝卻很難再從明軍身上佔到什麼便宜。於是在是否招安十八芝的這個問題上，熊文燦自然會更偏向於許心素的意見。
但這個問題歸根究底，卻還是因為海漢人的出現。正是因為他們給許心素提供了軍事援助，福建明軍才能打出了翻身仗，而十八芝卻由主動淪為被動，正面戰場上難有勝績，私底下與福建官府的招安談判也全部停了下來，勢力範圍在明軍打壓之下不斷縮小，處境越發地尷尬。
鄭芝龍不是太理解為什麼海漢人一定要想方設法地針對十八芝，說起來在珠江口海戰之前雙方也並沒有什麼樑子，連正面交道都沒打過，而那時候海漢人卻已經偷偷在向福建輸送武器了。福建局面吃緊之後，鄭芝龍當然也找過中間人試圖向海漢說和，最起碼要讓海漢停止對許心素一方的支援才行，然而海漢似乎並不買賬，只要是涉及到十八芝的話題，對方不管哪個級別的管事，都一律緘口不答，根本就不會回應任何跟和談有關的話題。
這種明顯的敵意也是讓鄭芝龍退無可退，如果十八芝對南日島的失利仍然沒有足夠大的反應，那說不定福建明軍和海漢人的聯合艦隊很快就會殺到馬公港了。相較之下，荷蘭人的條件雖然雖然很苛刻，但起碼是衝著銀子去的，而不是為了置十八芝於死地。兩相比較之下，雖然不滿荷蘭人的竹槓敲得這麼狠，但鄭芝龍依然只能選擇出錢讓荷蘭人助自己一臂之力。
錢天敦抵達福建，與鄭新知在大員港完成談判，幾乎就是前後腳的事情，雙方也基本是在同一時間開始進行下一階段的備戰。不過在備戰的細節上，雙方也依然是存在著比較大的差距。
南日島守軍一方的有利條件十分明顯，依託著大明這個此時在遠東依然是最為強大的帝國，不管是物資還是人力，都是盤踞在澎湖的十八芝所不能相提並論的。雖然福建水師的戰鬥力很有限，但要讓他們承擔一些運送物資的工作倒是難度不大。
從錢天敦抵達南日島開始，福建水師便按照海漢的要求，開始從附近的幾座城鎮源源不斷地送來各種補給和人力，在島上構築更為完善的防禦體系。錢天敦的手上有近千名作戰經驗豐富的老兵，有四大四小八艘戰船，還有上千的明軍可供呼叫，可以在作戰過程中施展的手段就比兩個月前攻打這裡的使團船隊要多得多了。何況攻難守易，錢天敦認為以兩千以上的兵力鎮守這個小島，列裝的又幾乎全是海漢武器裝備，對手就算一次性來個萬八千人，也很難能攻陷這裡的寨堡。
南日寨這個地方最早是明軍所築，後來撤軍荒廢之後才被海盜佔去，並對