領都押送了千名俘虜送來威遠城，湊出萬人之數，隨後陳平令人押來後光明天皇姐弟二人，讓他們看著炎黃軍將上萬倭人全部坑殺。
“不！你這個劊子手！放過我的子民吧，不要殺了，求求你不要殺他們！”
明正天皇和後光明天皇一會高聲謾罵，一會跪地磕頭祈求陳平高抬貴手，他們想不通倭國為什麼會遭遇這樣的慘劇，炎黃帝國為什麼不肯放過他們。
陳平冷冷的看著二人，當時華夏千千萬萬的百姓也是這麼磕頭求饒的吧，那些倭國軍人沒有半點憐憫，連孕婦嬰兒都不放過，他們殺人就算了，還喜歡虐殺，禽獸行為令人髮指。
既然現在自己穿越過來了，就一定不會再讓這樣的慘劇發生在華夏人身上，不將倭人屠戮殆盡，決不罷休！
當所有倭人坑殺完畢，陳平令士兵將二人吊死在萬人坑旁的一棵歪脖子樹上。
解決了本州島上的數百萬倭人，陳平令大軍重新集結，只在威遠城，華興城，鎮倭城各自留下五千人，反正本州島上一個倭人也沒有了，不存在任何威脅。
陳平令劉貴率海軍運載八十多萬大軍分別投入了九州島和四國島。
這兩個島上的倭國大名也曾經組織船隊，試圖救援本州島上的倭人，被劉貴的海軍全部擊沉，兩個島上六萬多名倭軍都隨著他們乘坐的戰船沉入海底。
現在海軍將這兩個島嶼再次封鎖，進入兩島的炎黃軍一路勢如破竹，九州島上秦升率領大軍佔領了長崎，鄭強率領大軍佔領了福岡，馬羽則率軍佔領四國島的高知。
隨後三人率領炎黃軍在兩座島上大肆殺戮，不論是倭國的平民百姓還是倭國的軍人都全部殺光，一個不留。
陳平則坐在海軍的蒸汽戰艦上，檢視著系統地圖，防止有倭國的漏網之魚，一旦發現有紅點跑出炎黃軍的包圍圈，則令三人派出軍隊按照他所指出的方位進行剿滅。
在這種高效率聯合作戰下，九州和四國兩座島上的倭人不用半個多月就全部剷除乾淨，經過清點一共剿滅了一百多萬倭人。
現在倭國只剩下最北面的北海道還沒有被清理了，陳平下令大軍重新登船，讓劉貴的海軍駛向北海道。