有馬忠房的船隊損失近半，又被大順軍的戰船包圍，退無可退。
他下令將所有戰船集體向大順軍的蓋倫船發起了衝鋒。
一時間，海面上百十艘戰船集體向大順軍的戰船衝了過去。
有部分倭國武士直接點燃了船隻，快速駕駛船隻，冒著大火向大順軍的戰船衝去，想要與大順軍士兵同歸於盡。
鄭成功見倭國士兵如此瘋狂，為了保障己方的蓋倫船不受損失，他立即下令蓋倫船退後，外圍包圍圈的所有龜船入場。
在倭國戰船和各種火船衝到大順軍蓋倫船之前，大順軍蓋倫船迅速撤出的包圍圈內。
接著，一艘艘龜船猶如導彈一般，向包圍圈中的倭國船隻發射而去。
倭國船隻失去了首要攻擊目標，不得已只得選擇和大順軍的龜船硬剛。
可是大順軍的龜船，並沒法使用跳幫戰術，而且又很難引燃。
倭國戰船被大順軍龜船撞擊後，紛紛在海面上翻覆，船上計程車兵掉入了海中。
有馬忠房站在船頭，看著己方一艘艘船隻被大順軍撞翻，心中越來越絕望。
倭國的小型關船已經基本被大順軍的龜船清剿完畢，全部被撞翻。
大順軍的蓋倫船再次入場，對倭國的安宅船發起了最後的進攻。
大順軍的炮彈如雨點般打在倭國安宅船的甲板、桅杆上。
一艘艘安宅船被陸續擊沉。
就連有馬忠房的安宅船也被大順軍的小船靠近，大順水兵搭上木板，想要登船活捉有馬忠房。
有馬忠房表情嚴肅，扭頭看了一眼九州島的方向，然後雙膝跪在了地上。
他將九州各大名派出的這支聯軍全部葬送，實在無顏再回到九州，面對其他大名，更無顏再面對幕府將軍和天皇。
擺在有馬忠房面前的，只有切腹自殺這一條路...
他抽出自己的武士刀，用士兵遞過來的毛巾擦拭乾淨了刀刃。
然後雙手拿著刀，將刀尖對準了自己的肚子，一刀刺了進去。
在大順軍士兵趕到，並且控制了有馬忠房所在的戰船時，有馬忠房在甲板上切腹自殺了。
陪他一起死的還有他的幾名家臣。
大順軍士兵還從沒見過對手的這種死法。
眾人看他的穿著像是指揮官的樣子，一刀將他的頭砍下，打算去向鄭成功和李自成邀功。
一直在遠處關注著戰局的松浦久信看到有馬忠房被大順軍包圍，又見到大順軍對他發起了衝鋒，就知道他一定凶多吉少了。
松浦久信帶領著自己手下計程車兵趕快向九州方向跑去。
戰場上，倭國船隻要麼已經沉沒，要麼就是被大順軍控制，已經全部沒有了戰鬥力。
海面上，還漂浮著不少倭國武士，抱著船隻的碎片在海上掙扎。
鄭成功按照李自成的授意，將海上飄著的倭國武士全部殺死，一個不留。
對馬島一戰，大順軍成功擊敗了九州島各大名湊出來的海上聯軍，並且成功逼的有馬忠房切腹自殺。
李自成在俘虜幫忙確認士兵獻上的人頭是倭國大名有馬忠房後，對士兵進行了嘉獎，然後命令士兵將有馬忠房的人頭直接拋到了海里。
隨後，他下令大軍向對馬島前進。
此時，松浦久信已經跑了，有馬忠房又被大順軍剿滅，對馬島已經完全沒有了倭國兵馬的護衛。
鄭成功在前，找了個合適戰船停泊的海港，率領士兵成功登陸了對馬島。
對馬島是位於倭國和棒子國之間的一座海島，面積將近700平方公里。
島嶼雖然面積很大，但是此時，島上的倭國居民只有數千人。