支兩千人規模的武裝在島上跟敵人進行周旋，為大部隊的出逃爭取更多的時間。這兩千人中有一半是鄭芝龍的私軍，另一半則是由抽籤出來的幾家一起湊人頭。這支部隊既然要留下來跟敵人戰到底，自然就得要做好戰死的準備了。但為了能夠擋住來勢洶洶的敵軍船隊，鄭芝龍現在也只能提前動用這支力量了。
在這支部隊出發之前，鄭芝龍讓人擺出銀箱，給每一名參戰人員都發了五兩白銀，如果能夠活著回來，還能拿到等值的另一半獎勵。不過收到銀子的海盜們大多都沒有任何輕鬆的表情，因為他們也知道這一去之後還能好手好腳活著回來的機會已經不大了。
第二支阻擊船隊在馬公港以西十海里處迎上了聯軍艦隊。與第一支很快覆滅的阻擊船隊有所不同的是，這支船隊幾乎已經出動了十八芝現有的全部戰船，而指揮這支船隊的也是鄭芝龍的族人鄭芝莞，戰鬥意志遠比被強迫上陣作戰的第一支船隊要堅定得多。
在海漢戰船的炮火打擊之下，這支船隊沒有再次一擊即潰，而是頂著炮火衝上來，以十艘或更多艘戰船齊攻一個目標的戰法進行作戰。
不得不說這樣的戰法雖然代價慘重，但的確還是有一定的效果。開戰不久便有一艘“探險級”戰船“梭子蟹號”因為未能及時轉向，被五艘海盜船直接貼了上來。儘管船上利用葡萄彈迅速清空了其中一艘船的甲板，但另外幾艘海盜船仍然成功地實現了接舷戰。
大呼小叫的海盜們揮舞著鋼刀和魚叉，踩著船舷跳向“梭子蟹號”的甲板。不過在排槍的迎接之下，也只有十之三四的海盜能夠成功地跨過兩舷之間的距離，其他的倒黴鬼基本都中槍栽進了海里。
讓海盜們感到很鬱悶的是，即便成功登上了敵軍戰船的甲板，短兵相接之下他們也仍然沒能取得什麼優勢。這些身著靛藍色短衫，面板黝黑的海漢水兵居然統統都配備了一種前端配著閃亮矛尖的火銃，稍有戰鬥空隙便是至少兩到三輪的排槍，然後便以手裡如同短矛一般的火銃接戰。雖然個別武勇突出的海盜也能憑藉手裡的武器傷到對方，但往往都會立刻招致三四把短矛的夾攻。而這玩意兒的威力也絲毫不亞於火銃，被捅上一記往往馬上就倒地不起了。
海漢海軍目前所使用的火槍其實與安南民團是一樣的型號，都是短管大口徑燧發槍配備一尺二寸的刺刀。這種短管火槍的設計初衷就是為了適用於比較狹窄的作戰空間，並透過大口徑發射霰彈來覆蓋近距離區域，在海上接舷戰這種狀況下非常適用，一個班的水兵一輪齊射，火力幾乎就可以覆蓋一側的船舷了。
海盜們雖然接連不斷地跳幫到“梭子蟹號”上，但所取得的戰果十分有限，甲板上橫七豎八倒下的軀體，倒是有超過八成都是十八芝的人。
而留給海盜們發揮的時間也並不長，僅僅片刻之後，另外兩艘擔任護衛艦的“探索級”戰船便迅速靠攏“梭子蟹號”，近十門火炮在不到二十米的距離上對這幾艘海盜船進行了轟擊。
而另外幾艘試圖要嘗試攔截“威嚴級”主力艦的海盜船下場則更為悽慘，因為“威嚴級”戰船的火炮甲板佈置是上層小口徑，下層大口徑，船舷比海盜船高出一大截，雙方戰船靠近之後，下層火炮甲板正好就對著海盜船的甲板，一發炮彈過去就如同風捲殘雲一般，將船板連同海盜一起撕成碎片，硬生生在海盜船上撕出一道橫貫船身的大口子。