於他們前次在納土納島的表現堪稱灰頭土臉，布勞沃更是連命都丟在了島上，這兩人在科恩心目中的份量自然是大大地打了折扣。斯派克斯雖然活著回到了巴達維亞，但公司在近期內肯定是不會再啟用他，何況他身上還揹負著某些沒來得及洗清的罪名。
“範迪門先生，儘管阿姆斯特丹的委任狀或許要明年才能送到，但我決定提前授予你海軍上將的許可權，並全權負責奪回納土納群島的作戰準備和交戰指揮，你是否願意接受這個任命？”科恩緩緩地問道。
範迪門立刻起身，挺直了腰板應道：“能得到總督大人的信任，本人倍感榮幸，定會竭盡全力完成使命！”
科恩輕輕地了頭道：“有人反對我的這個任命嗎？”
他先宣佈任命，到這個時候才詢問眾人的意見，很顯然是不想聽到任何反對的聲音。而與會眾人也都很識趣地向範迪門表示了祝賀，並紛紛保證會盡量配合他的備戰工作，不會給公司的作戰計劃拖後腿。
至於大員港方面，科恩表示除了督促當地繼續加緊建造城防工事之外，也要告誡漢斯收斂一些，不要再次介入到大明與十八芝的武裝衝突中，以免給躍躍欲試的海漢人更多的可趁之機。至於漢斯在信中提出讓巴達維亞派出武裝船隻和人員加強大員港防禦實力的要求，則直接被科恩無視了——不先把納土納島的事情解決，怎麼敢放心向大員那邊派人派船過去？
還有一件事科恩也沒有忘記，那就是幫斯派克斯洗刷罪名。由於範隆根的歸來，納土納島一戰終於有了第二名指揮官的證言，而這也正是證實斯派克斯所的狀況是否屬實的最有力證據。為此公司董事會召開了為期兩天的聽證會，對範隆根進行了詳細的盤問，以確定他所的情況與斯派克斯所講的完全一致。
這個時候範隆根作為一個長期在海上航行的船長，他的航海日誌就派上了大用場。在這本日誌中範隆根詳細記述了當時在納土納島與島上武裝交戰的全過程，而這也成為了把斯派克斯從畏戰、指揮失職、戰場脫逃等罪名中拯救出來的有力憑證。
不過即便是洗脫了這些莫須有的罪名，斯派克斯也依然沒辦法立刻獲得重新啟用的機會。就算他沒有那些罪名，但納土納島的慘敗依然是不爭的事實。兩名軍事主官之一的布勞沃已經戰死沙場，無法追究其責任，這個鍋也只能由他來背了。至於範隆根，他的身份還僅僅只是商船船隊的指揮官，能夠參加軍事行動已經算是不易，也不會有誰去追究他的指揮責任。
範迪門接手了東印度公司海上武裝的指揮官職務之後，便開始著手準備攻打納土納島的事宜。有鑑於前次的失敗經驗，東印度公司想要收復納土納群島，所做的準備工作就必須得比之前更為充分才行。上次出動的兵力顯然並不足以撼動對手在島上部署的防禦陣地，考慮到對方的海船全部沒見著影子，有可能在島上駐守的還並非主力，那麼再次出征的時候就必須把撞上對方主力部隊的可能性考慮進去，再僅僅只是上次出動的那兵力顯然是不夠穩妥。
範迪門根據前次的交戰狀況進行了估算，認為至少要派出三千人左右的兵力，才能保證在島上的交戰中以火力壓制住對手取得主動，然而要調集到他所需的這麼多兵力，對東印度公司來也絕非易事。
東印度公司在整個遠東地區的武裝人員有將近萬人，這絕對是一個很有威懾力的數字，不過這些人員分散部署在公司的數十個殖民地，短時間內是沒法完成快速聚集的。這種弊端的根源還是在於殖民地分佈太過分散，沒辦法集中部署兵力，類似納土納島失守之前，島上也有一批武裝人員和訓練的土著協從軍，但很顯然這象徵性的防禦力量並不足以阻擋對手的進攻。
巴達維亞周邊地區是東印度公司重佈防的區域，僅在巴達維亞城就駐紮了超過三千名武裝人員