。而海漢民團這種強行解除武裝的舉動，也並沒有引發出大的衝突，帶頭反抗的人被鎮壓之後，剩下的人基本上都選擇了順從。
錢天敦和顏楚傑分別坐鎮城南和城北，指揮當晚的行動。城門和交通要道的武裝清剿都比較順利，衛所軍並沒有出現大規模的抵抗，民團這邊甚至都沒有開過槍，就很能順利地拿下了三處城門和南北、東西兩條貫穿城區的大道。
但在清理城北的各處衙門時，民團軍終於遇到了一些小小的麻煩，不得不動用了武力，擊潰了試圖反抗的一夥明軍。而當聽到槍聲的官員們試圖查明發生了什麼事的時候，才發現他們已經被民團軍在無聲無息中實施了軟禁，連自家院子都出不去了。
民團軍徹夜未停，城裡的民眾一整夜都聽到民團軍的腳步聲在街上來來去去，間或還有一陣一陣的槍聲傳來，許多人都是縮在被窩裡嚇得整夜未眠，唯恐下一刻就被外面的亂兵衝進自己家中。
清剿行動一直持續到天色矇矇亮的時候才告一段落，紅著眼睛王湯姆和顏楚傑在城中間的一家酒樓裡碰面，吃個早飯順便通報一下昨晚的行動結果。
“算你運氣好，抽到城南了，城北這幫孫子折騰了整整一夜！”顏楚傑慢條斯理地撐了一個懶腰，很是忿忿地說道：“我這邊一晚上抓了兩百多人，城北的牢房都塞不下了，只能臨時徵了一個院子，先把人關起來。”
王湯姆笑道：“你別嫌麻煩，你們陸軍麻煩的事情還在後面！昨晚我抽空看了看錢天敦送過來的報告，光是府城周邊方圓這百十來裡，大大小小的地主就有兩三百戶，等回頭清查土地才有得你叫苦的時候！”
“誰說不是啊！”一向以堅毅果敢著稱的顏楚傑臉上也露出了為難的神色：“到時候徵地必定會起很多糾紛，一出事就得我們民團出面鎮壓，這差事可不太好乾……先不說這個，現在府城這邊已經基本控制住了，我看今天就可以跟錢天敦那邊聯絡，開始逐步移交控制區。”
王湯姆點點頭道：“那我回頭就聯絡他那邊。抓起來那些本地的官員怎麼辦？”
顏楚傑道：“按照執委會的安排，基層的辦事人員全部暫時留用，至於掌印的大官……回頭就安排押送他們去江邊，交給你的人了。”
按照事前的計劃，在對瓊州府城實現了控制之後，民團軍將要把這裡的高階官員全部先集中起來，秘密送去三亞那邊進行囚禁，以防止他們在這邊就地組織起某些反抗舉措。至於這些人會被囚禁多長時間，那就要視他們的思想改造進展和海漢與大明之間大的局勢走向而定了。
而海軍的作戰任務，到這個時候也算是告一段落，雖然接下來他們還得繼續保持對瓊州海峽的封鎖，但軍方認為廣東方面在短時間內並沒有派出大批戰船來瓊州島的可能。不過王湯姆打算趁著這個難道的機會，在瓊州海峽裡舉行軍事演習，好好演練一下艦隊的協同作戰能力。
在10月20至23日期間，民團軍共有近三千人的部隊進駐到瓊州府城內外，並進行了多次的“全城清剿海盜奸細”的活動，前後有五十餘人在這幾天的清剿當中喪生——當然這其中並沒有海漢民團的人，基本上都是試圖反抗的大明軍中人員。
在城內的民眾還不太明白事態走向的時候，數十名本地高官已經被秘密押解出城，送上了停在南渡江上的帆船，然後一路送去三亞了。而瓊州府城的控制權也就徹底易主，從大明換成了海漢。在接連進行了三天的封城令之後，城內的民眾終於可以自由地走上街頭，看一看海漢民團所張貼的安民告示。
府衙門口，一群民眾正圍觀牆上貼出來的安民告示，一名書生站在最前面，搖頭晃腦地念道：“……為平定匪亂，現瓊州府城之治安管轄權暫由海漢民團代管，一應民政事務，皆由府城臨時管理委員會承擔……