進軍福建計劃的確定，執委會決定對鎮南港的功能設定進行調整，將整個鎮南港全部劃為軍事基地，同時把這裡的民用設施都搬遷到香港島北邊——銅鑼灣避風塘附近的港口已經完成了第一階段的工程建設，可以開始投入日常運營了。
執委會作出這樣的調整，一是因為已經拿下了整個香港島的控制權，而港島北邊所擁有的大片臨海平原顯然比鎮南港狹窄有限的地區更具開發價值。二來將鎮南港地區劃為軍事基地，也是為了服務於今後一段時期的戰略發展需要。
海漢要大舉進攻澎湖，就勢必要派出相當數量的艦隊前往福建。但如果這個動作太早，勢必就會提前引起十八芝的警惕，從而給予他們更多的反應時間。軍委所制定的計劃，是將艦隊先集中到珠江口，有可能的話還要安排幾次演習。等到行動開始之前，再開拔前往福建執行作戰計劃。
海漢在珠江口的據已經有好幾處，但目前卻沒有適合大部隊駐紮的地方。番禺的位置太過接近廣州，如果海漢艦隊大舉沿珠江上行，勢必會引起廣東官府的誤判，從而引起不必要的後果。而萬山島的港口過，所能容納的船隻的數量和噸位都很有限，並不適合作為軍港使用。也就只有香港島這邊，可以將位於西南角的鎮南港單獨劃出來，交給軍方使用。
因為香港島天然的地形，鎮南港與位於北邊的沿海平原是完全隔離開來的，這也可以在最大限度上保證這裡作為軍事基地的機密性。只要將鴨脷洲兩頭的航道一封鎖，中間這段海峽裡停靠了多少船隻，外面根本就查探不到。對於希望在開戰前保守住兵力部署機密的軍方來，鎮南港的確是一個極佳的選擇。
要把這裡變成軍事基地，當然還有一個必要的前提，那就是把民用設施全部搬走。所以趁著秋交會商人云集的機會，執委會宣佈了對鎮南港進行整體搬遷的決定，所有在鎮南港有固定資產的商家，都將限期搬離此地，並在港島北部的新開發區獲得相應的補償。
至於陳林的船被陳一鑫徵用，這也是軍方的安排，讓陳林這種知根知底的海商出船出人，到三亞鐵爐港去運輸戰備物資，以求在最大限度上掩蓋海漢已經在進行之中的戰前準備。
陳一鑫自然不會告訴陳林運的貨物是什麼，而陳林也很知趣地不去進一步打聽這些訊息——既然對方不，那自然是不便外露的軍情，自己還是儘量不要去多事為好。陳一鑫既然已經了會付相應的運費，那應該也不會賴賬，至少不需要自己貼錢跑這一趟。反正跑個來回也就十幾天時間而已，並不會對自己的生意有太大的影響，陳林想想也就寬心了。
陳一鑫安排了數百名士兵，到碼頭上給陳林的船隊卸貨。有了這麼幾百個壯勞力，第二天便將這次從潮州運來的六船木材都卸完了。又休整了一天之後，陳林便帶著船隊離開鎮南港南下。陳一鑫專門調了幾名海軍的人，隨陳林一起南下，擔任領航的職責。
類似這樣的情形，不僅在鎮南港一地出現，鄰近的萬山島、番禺李家莊、廣州城外的珠江碼頭，以及海南島的儋州、瓊州府城港口，都有與海漢關係較熟的海商接下了承運業務。這些分屬不同船主的商船將在今後的一兩個月裡分批前往三亞，把軍方所準備的戰備物資運送到鎮南港。同時福建方面也會派船過來，將這些物資運往金門島。即便是十八芝在廣東安排有坐探，也很難察覺到海漢在暗地裡所採取的這些手段。