就在此時，一名報信兵匆匆趕來後院，這是鄭芝龍的親兵，帶來了重要訊息。他一進來，就看見了鄭成功，張了張嘴又閉上了嘴巴。鄭芝龍道：“說，沒有什麼不能說的。”
報信兵只好抱拳道：“大帥，清軍浙江駐防軍主帥博洛麾下大將，鈕鈷祿陳泰、鈕鈷祿陳錦已經帶領三萬清軍越過仙霞關。四將軍他，他已經併入清軍大隊。另有清軍李成棟部兩萬人從溫州出發越過分水關。另有江西駐防軍譚泰、何洛會、耿仲明、譚布四路人馬齊頭並進穿過百丈嶺到谷口關一線，進入福建。”
鄭芝龍揮揮手道：“知道了，你先下去吧。”
鄭成功瞪大了眼睛，父親竟然真的下令獻出關隘了，數路清軍，兵馬最少七八萬，福建軍十一萬分散各地，加上投降的，兵力所剩無幾。鄭成功立刻道：“父親，回頭是岸，我現在立刻召集福京守軍，加上沿岸水師以及我本部兵力，至少還有三四萬人，在福京外圍佈防，清軍縱然兩倍於我，也不一定能突破。”
鄭芝龍道：“不用費心了，我心意已決，全軍北上，跟博洛匯合。”
“父親！你若是如此，我們今日恩斷義絕，斷絕關係！”鄭成功道。
鄭芝龍猶豫了一下，但很快目光又變得堅定起來，“作為我的兒子，你應該聽我的，放下武器，跟我一起北上。”
“不！絕不！”鄭成功道。話音剛落，就有衛士來稟報，說是鄭成功麾下五虎將帶兵入城，控制了福京東門和南門。
鄭芝龍道：“你要起兵？”
“至少，我不能允許你把陛下帶走。”鄭成功冷冷道，此刻，站在他眼前的已經不是那個曾經高大偉岸有理想抱負的鄭芝龍，而是一個徹頭徹尾的叛徒，一個投機者。他說的那些大道理，又是為了將士們著想，又是不想生靈塗炭。說白了，就是想投靠清廷，在清廷混到更高的位置上，可這一次，他恐怕錯了，蠻夷怎麼會有信用？
本來鄭芝龍確實是想把隆武帝綁了的，但是鄭成功竟然帶兵入城，一萬多人進城護住了皇宮。這麼看來，隆武帝是帶不走了。鄭芝龍還有僅存的一絲人性，虎毒不食子，總不能殺了鄭成功。
鄭芝龍長嘆一聲，“唉！罷了！你走你的陽關道，我走我的獨木橋，你放心，我去南京，一定會告訴清兵，不許傷害你一根汗毛。”
鄭成功卻拒絕道：“錯了，父親就跟多爾袞和洪承疇說，大明參將鄭成功，必將跟他們血戰至最後一兵一卒。”
鄭芝龍邁出了書房的大門，衙門外已經亂作一團，鄭成功大軍進城，效忠鄭芝龍的軍隊跟他們緊張對峙，戰爭一觸即發，城內百姓都嚇尿了，四散奔逃。就連皇宮內的隆武帝也坐不住，跑到宮門附近眺望大街，想弄清楚怎麼了。
鄭芝龍站在庭院中，早有親兵給他換上了鎧甲。鄭芝龍將頭盔戴好，忽然背後響起一個聲音，“父親！”
鄭芝龍猛然回頭，只見鄭成功緩緩下跪，磕了一個頭道：“這是我最後一次叫你父親，今生我們再難相見，保重！”鄭成功用力抱拳道。
鄭芝龍咬了咬牙，頭也不迴帶著一隊親兵出了大門。街面上，大隊人馬早已準備好，從鄭成功進門的那一刻起，鄭芝龍就已經決定，今天要走了。只見他翻身上馬，最後看了一眼水師衙門，對手下士兵道：“願意留下的就留下，願意跟本帥走的，現在出城！”
隆武二年四月，鄭芝龍領兵出福京北上，於十幾天後跟清軍在蒲城匯合，福建領土大部淪陷。